魔法学園の落ちこぼれ、異能の才能に目覚める
リリア・グレースは、魔法使いのエリート学院グリフォン・アルカナに入学したが、彼女の魔法適性はほぼゼロだった。入学試験では最下位で、最低クラスに配属される。誰も彼女に期待していなかった。
しかし、初めての授業でリリアは驚くべき事実に気づく。彼女は魔法を使うのではなく、魔法を破壊するのだ。まるでシステムのバグのような、誰も知らなかった能力。それが、適切な時に彼女の最大の強みとなりうるのだ。
クラスメイトには、天才だが社交性ゼロの落ちこぼれカエル、己の魔力を恐れる少女イヴ、そして謎に包まれた転校生シェフィールドがいる。四人は共に、学院を襲う一連の「魔法暴走事件」に巻き込まれていく。
リリアの力だけが、それらを解決できる唯一の手段だった。次第に彼女は、自分が失敗作ではなく、ただ違った才能を持っているだけだと理解し始める。しかし、その能力は本当に他者を救えるのか？彼女はここにいるに値するのか？
学園祭のゲームの最中、リリアはカエルに対する自分の気持ちが変わっていることに気づく。天才ゆえの孤独に苦しむ彼を見つめながら、二人の距離は共有する時間とともに徐々に縮まっていく。
やがて、事件は偶